Fattore chimico, fisico o biologico che può causare una malattia. Per esempio, sono detti patogeni batteri e virus che sono in grado di provocare un’infezione.

In fibrosi cistica bronchi e polmoni sono frequentemente interessati da bronchiti e broncopolmoniti ricorrenti, spesso causate da batteri patogeni come Pseudomonas aeruginosa o Staphylococcus aureus.