Una componente essenziale della membrana esterna del batterio Pseudomonas aeruginosa si chiama lipopolisaccaride. Esso media diverse interazioni con l’ambiente e l’organismo ospite ed è responsabile dell’elevata resistenza intrinseca agli antibiotici. In questi ultimi anni sono stati fatti molti progressi per comprendere come questa molecola venga trasportata dal sito di sintesi (citoplasma e membrana interna) verso la membrana esterna del batterio, sua destinazione finale. Il progetto di ricerca si concentra su due proteine, da noi scoperte, che sono componenti della macchina per il trasporto del lipopolisaccaride. Le due proteine, che legano il lipopolisaccaride ed interagiscono tra di loro, rappresentano ottimi bersagli per la progettazione di nuovi farmaci. Scopo del progetto è lo studio dettagliato (tramite tecniche biofisiche e di genetica molecolare) di queste proteine in P. aeruginosa e l’analisi delle loro caratteristiche che non sono tuttora state definite, compresa la struttura cristallografica. Quindi, basandoci su queste conoscenze, progetteremo e sintetizzeremo inibitori potenziali (piccole molecole o peptidi) che saranno saggiati per la loro attività antibatterica.
To exploit LPS transport as a process for the development of novel antimicrobials. This multi-faceted cellular target can be exploited by different approaches for drug discovery. We will target not only two key P. aeruginosa proteins LptA and LptC but also their assembly pathway into the LPS multiprotein transport complex and their binding to LPS. Based on structural information already available and on the expected results of this interdisciplinary project we will design and synthesize inhibitors (small molecules and small peptides) that will be tested in vivo and in vitro to identify potential lead compounds.
