Con l’obiettivo di orientare la diagnosi e definire in modo dettagliato le diverse fasi della malattia polmonare in persone con FC e infezioni da MNT, sono stati seguiti due approcci: i) definire marcatori batterici e quindi valutare la virulenza dei ceppi di M. abscessus isolati a diversi stadi della malattia polmonare e ii) identificare marcatori dell’ospite (per esempio, cellule infiammatorie) attraverso l’uso di nuove tecniche di omica (analisi dell’RNA di singole cellule, che consente la produzione di informazioni su diverse variabili biologiche, in numero molto elevato e nello stesso intervallo di tempo) e in particolare grazie alla tecnologia chiamata sequenziamento dell’RNA di singole cellule. Sul versante dei micobatteri è stato osservato che ceppi di M. abscessus con caratteristiche fenotipiche diverse possono mostrare una diversa virulenza. Sul versante della risposta dell’ospite sono stati condotti studi preliminari sugli RNA dei monociti, un tipo di globuli bianchi molto implicati nella risposta difensiva contro i NTM. Nel complesso questo progetto ha consentito di collezionare nuovi potenziali marcatori che verranno validati su un numero maggiori di soggetti nel progetto FFC#7/2022. Lo scopo finale è quello di validare nuovi biomarcatori, per fornire nuove “evidenze di valutazione” che supportino in futuro una migliore diagnosi della malattia polmonare in FC.
Non-Tuberculous Mycobacteria (NTM) infections are frequent in the adult population with CF, causing sometimes severe lung disease, sometimes a much milder outcome. Therefore, it would be important to identify some biological markers, possibly from both the Mycobacterium and the CF patient’s immune response, in order to anticipate the outcome.
To unravel these markers, we aimed at: i) at characterizing the virulence of M. abscessus strains isolated at different stages of lung disease and ii) at identifying host markers (e.g. inflammatory cells) through the use of new Omics techniques (analysis of the RNA of single cells which allow the production of information on various biological variables, in very high numbers and in the same interval of time) and in particular thanks to the technology called Single cell RNA Sequencing. Concerning mycobacteria, we have identified that M. abscessus strains with different phenotypic characteristics display a different virulence. In terms of host response, we have preliminarily studied the RNAs in monocytes, a type of white blood cell highly involved in the defensive response against NTMs. Overall, this project collected and defined new candidate potential markers that will be validated in a larger number of subjects in the next FFC project (FFC#7/2022). As anticipated, the final goal is to validate these new biomarkers, to provide new evaluation based-evidences that will support a better diagnosis.
Abstract presentati a congressi scientifici
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